Родился в 1879 г. в Санкт-Петербурге. Закончил архитектурное отделение при Высшем художественном училище Академии художеств. После учебы – проектирует памятники, скульптуры, занимается созданием музея старого Петербурга. После революции переезжает в Ростов на Дону. В 1920 г. был арестован местной ЧК, но вскоре освобожден. В 1922 г. он возвращается в Петроград, и начинает работать в Государственном Русском музее в качестве хранителя историко-бытового отдела.
В марте 1931 г. Николай Евгеньевич был арестован ОГПУ по обвинению в шпионаже в пользу Франции. В начале 1932 г. он был приговорен Коллегией ОГПУ к высшей мере наказания – расстрелу. Приговор был заменен на 10 лет лагерей. Список работ Н.Е. Лансере за время работы в бюро (с июля 1931 г. по 28 июня 1935 г.) занимает почти две страницы. Среди них проекты отделки кабинетов Наркома внутренних дел и зала заседаний в Кремле, проекты фасадов административного здания на Литейном проспекте, реконструкция Конногвардейского манежа под гараж ОГПУ, проект внутренней отделки правительственной дачи на Каменном острове и др. В 1935 г. был досрочно освобожден.
В июне 1938 г. снова арестован, вновь обвинен в шпионаже и приговорен к 5 годам лагерей. Умер в 1942 г. на пересылке в Саратовской тюрьме. Реабилитирован в 1957 г.